Solo para descartar podrias probar lo siguiente:
1) Ejecutarlo con un usuario NO SYSDBA conectado solo a una instancia en particular
expdp system/manager@instancia1 full=y dumpfile=dmp_daily:full%U.dmp logfile=log_daily:full.log job_name=export_full
expdp system/manager@instancia2 full=y dumpfile=dmp_daily:full%U.dmp logfile=log_daily:full.log job_name=export_full
2) Ejecutarlo con un usuario NO SYSDBA conectado a un SERVICE, que incluya instancia 1 y la instancia 2 (la del nodo que se evidencia)
expdp system/manager@service full=y dumpfile=dmp_daily:full%U.dmp logfile=log_daily:full.log job_name=export_full